2001年3月，中国科学院决定并报经中央机构编制委员会批准，将中国科学院陕西天文台更名为中国科学院国家授时中心，标志着我国建立了基本完善的时间频率体系。

　　进入新世纪，国家授时中心利用在时频领域的长期技术积累，创新性地研制建设了“中国区域定位系统”，在定位和授时方面性能卓越，满足了国家急需，为中国第二代卫星导航系统研制建设作出突出贡献，因此荣获国家科技进步特等奖，国家授时中心也成为北斗系统建设的一支重要力量。

　　进入新时代，国家授时中心勇挑重担，承担了国家重大科技基础设施——高精度地基授时系统、国家时频体系等重大任务，国家授时中心已然成为国家时空体系建设的一支重要力量。

　　2018年11月，习近平总书记为国家授时中心承办的的“联合国全球卫星导航系统国际委员会第13届大会”发来贺信，擘画了我国综合时空体系的未来蓝图，在2035年我国基本实现社会主义现代化之时，一个更加泛在、更加融合、更加智能的综合时空体系将呈现在世人面前，国家授时中心为国而生，向时而立，将为此目标而奋斗！